Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MLH3Q9UHC1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms