Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms