Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms