Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms