Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms