Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms