Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NECTIN3Q9NQS3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NECTIN3Q9NQS3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NECTIN3Q9NQS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms