Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms