Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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