Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms