Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD3Q9BZ95 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms