Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms