Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms