Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED18Q9BUE0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED18Q9BUE0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms