Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TINF2Q9BSI4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TINF2Q9BSI4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms