Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms