Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms