Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VRK1Q99986 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VRK1Q99986 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VRK1Q99986 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms