Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPF18Q99633 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPF18Q99633 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPF18Q99633 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPF18Q99633 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms