Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms