Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms