Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms