Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SPTSSAQ969W0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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SPTSSAQ969W0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SPTSSAQ969W0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPTSSAQ969W0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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