Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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