Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms