Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms