Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms