Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms