Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms