Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms