Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms