Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms