Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms