Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms