Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPY1Q3B7I2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPY1Q3B7I2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPY1Q3B7I2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPY1Q3B7I2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPY1Q3B7I2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNPY1Q3B7I2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms