Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms