Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms