Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT16Q17RD7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms