Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms