Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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