Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms