Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms