Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms