Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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