Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAPVD1Q14C86 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
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