Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms