Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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