Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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