Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms