Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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